【本文包含了一些相当硬核的病毒感染机制和相关术语,不过不要担心,我已经尽可能用大家都看得明白的语言去写了,而且,我觉得每一个感兴趣的人,都应该去好好了解下相关的机制。】
在我看来,现在我们集中了大量的医疗救护力量在对抗病毒,但有一个非常重要的地方却可能没有得到我们同样重视,甚至说可能被忽视了。
目前已知的病毒中,蝙蝠冠状病毒RaTG13(上图蓝线)和新冠病毒最近,全基因组层面的序列相同度达96%。但在关键的刺突蛋白(S)的受体结合区域,序列相同度最低(~90%)。上图横坐标是新冠病毒基因组核酸位点编号,纵坐标是核酸序列相同度,图片来自石Zl课题组Nature一文中图1c。
上面粉红色的一团带子是刺突蛋白的S1部分,下面的黄绿色的是细胞表面ACE2 蛋白,可见两个蛋白之间需要有几个位点紧密配合,才能一次形成4-5根氢键,有足够的力量把病毒沾上。之后更多的刺突蛋白和ACE2 结合,才能把病毒颗粒稳定在细胞表面,为膜融合做准备。
穿山甲冠状病毒的S蛋白的受体结合结构域(RBD)实际上与SARS-CoV-2的RBD几乎完全一致,只相差1个氨基酸。
图中画红框处可以明显看到PRRA是其它三个野生的宿主身上找到的病毒所都没有的。
根据这个领域的一些专业朋友的意见,除蝙蝠和穿山甲之外,第三种中间宿主的存在是可能的。